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跑電泳時(shí)的注意事項

日期:2024-07-24 10:13
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摘要:跑電泳時(shí)的注意事項

那么下面上海嘉鵬科技有限公司為大家簡(jiǎn)單介紹一下關(guān)于跑電泳時(shí)的注意事項:

 影響電泳分離的主要因素:

1. 待分離生物大分子的性質(zhì):待分離生物大分子所帶的電荷、分子大小和 性質(zhì)都會(huì )對電泳有明顯影響。一般來(lái)說(shuō),子帶的電荷量越大、直徑越小、形狀 越接近球形,則其電泳遷移速度越快。

2. 緩沖液的性質(zhì):緩沖液的 pH 值會(huì )影響待分離生物大分子的解離程度, 從而對其帶電性質(zhì)產(chǎn)生影響,溶液 pH 值距離其等電點(diǎn)愈遠,其所帶凈電荷量 就越大,電泳的速度也就越大,尤其對于蛋白質(zhì)等兩性分子,緩沖液 pH 還會(huì ) 影響到其電泳方向,當緩沖液 pH 大于蛋白質(zhì)分子的等電點(diǎn),蛋白質(zhì)分子帶負 電荷, 其電泳的方向是指向正極。 為了保持電泳過(guò)程中待分離生物大分子的電 荷以及緩沖液 pH 值的穩定性, 緩沖液通常要保持一定的離子強度, 一般在 0.02 -0.2,離子強度過(guò)低,則緩沖能力差,但如果離子強度過(guò)高,會(huì )在待分離分 子周?chē)纬奢^強的帶相反電荷的離子擴散層(即離子氛) ,由于離子氛與待分 離分子的移動(dòng)方向相反,它們之間產(chǎn)生了靜電引力,因而引起電泳速度降低。 另外緩沖液的粘度也會(huì )對電泳速度產(chǎn)生影響。

3. 電場(chǎng)強度:電場(chǎng)強度(V/cm)是每厘米的電位降,也稱(chēng)電位梯度。電 場(chǎng)強度越大, 電泳速度越快。 但增大電場(chǎng)強度會(huì )引起通過(guò)介質(zhì)的電流強度增大, 而造成電泳過(guò)程產(chǎn)生的熱量增大。電流在介質(zhì)中所做的功(W)為:W=I2.R.t 式中:I 為電流強度,R 為電阻,t 為電泳時(shí)間。 電流所作的功絕大部分都轉換為熱, 因而引起介質(zhì)溫度升高, 這會(huì )造成很多影響:

(1)、 樣品和緩沖離子擴散速度增加,引起樣品分離帶的加寬;

(2)、 產(chǎn)生對流,引起待分離物的混合;

(3)、 如果樣品對熱敏感,會(huì )引起蛋白變性;

(4)、 引起介質(zhì)粘度降低、電阻下降等等。電泳中產(chǎn)生的熱通常是由中心向外周 散發(fā)的,所以介質(zhì)中心溫度一般要高于外周,尤其是管狀電泳,由此引起中央 部分介質(zhì)相對于外周部分粘度下降,摩擦系數減小,電泳遷移速度增大,由于 中央部分的電泳速度比邊緣快,所以電泳分離帶通常呈弓型。降低電流強度, 可以減小生熱, 但會(huì )延長(cháng)電泳時(shí)間, 引起待分離生物大分子擴散的增加而影響 分離效果。 所以電泳實(shí)驗中要選擇適當的電場(chǎng)強度, 同時(shí)可以適當冷卻降低溫 度以獲得較好的分離效果。

4. 電滲:液體在電場(chǎng)中,對于固體支持介質(zhì)的相對移動(dòng),稱(chēng)為電滲現象。 由于支持介質(zhì)表面可能會(huì )存在一些帶電基團, 如濾紙表面通常有一些羧基, 瓊 脂可能會(huì )含有一些硫酸基,而玻璃表面通常有 Si-OH 基團等等。這些基團電 離后會(huì )使支持介質(zhì)表面帶電, 吸附一些帶相反電荷的離子, 在電場(chǎng)的作用下向電極方向移動(dòng),形成介質(zhì)表面溶液的流動(dòng),這種現象就是電滲。在 pH 值高于 3 時(shí),玻璃表面帶負電,吸附溶液中的正電離子,引起玻璃表面附近溶液層帶 正電,在電場(chǎng)的作用下,向負極遷移,帶動(dòng)電極液產(chǎn)生向負極的電滲流。如果 電滲方向與待分離分子電泳方向相同,則加快電泳速度;如果相反,則降低電 泳速度。

5. 支持介質(zhì)的篩孔: 支持介質(zhì)的篩孔大小對待分離生物大分子的電泳遷移速度 有明顯的影響。在篩孔大的介質(zhì)中泳動(dòng)速度快,反之,則泳動(dòng)速度慢。

關(guān)于膠回收切膠的一點(diǎn)注意事項:

1. 電泳的 buffer 和 gel 都是新制的, 切膠的臺子清理干凈, 刀片*好洗凈, 總之一句話(huà)就是保證切下的帶沒(méi)有外源 dna 污染。

2. 切膠是要把整個(gè)目的片斷所在位置的膠全部回收。為了減少膠的體積,可以 用相對比較薄的膠來(lái)做,只要夠點(diǎn)樣即可,也可采用薄而寬的梳子來(lái)跑膠。

3. 關(guān)于防護,在一般有機玻璃后就足夠了,戴上防護面具以保護眼睛,如果戴 樹(shù)脂眼鏡就可以了。要是非常害怕紫外照射,或者對于膠有特殊要求,例如要 求不含 EB, 可以采用點(diǎn) marker 和帶刻度的尺子一起照相的方法來(lái)確定目的條 帶在膠上的位置進(jìn)行切膠。   4. 按照正常程序點(diǎn) marker 跑膠,然后切下有 marker 的膠,EB 染色,紫外燈 下與帶刻度的尺子一起照相。由于要回收的帶與 marker 間的相對位置已知, 根據尺子來(lái)衡量未染色膠上目的帶的位置即可。 如果覺(jué)得很難判斷, 可以直接 在 marker 邊點(diǎn)少量的樣,這樣位置就容易確定了。

 

以上就是上海嘉鵬科技有限公司為大家整理總結關(guān)于跑電泳時(shí)的注意事項。

 

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