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PCR新手指南:快速PCR技術(shù)與快速PCR儀的區別

日期:2024-07-31 14:12
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摘要:在PCR儀上完成個(gè)PCR反應所需要的時(shí)間決定于以下幾個(gè)因素: 1、模塊升溫和降溫時(shí)間 2、模塊與PCR管內溫度平衡時(shí)間 3、延伸時(shí)間 4、循環(huán)次數 下面就以上幾點(diǎn)做點(diǎn)分析,以便大了解快速PCR技術(shù)與快速PCR儀的區別。 1、模塊升溫和降溫度時(shí)間 PCR儀般會(huì )標明升溫速度和降溫速度,但標的大多是大變溫速度,也就是說(shuō)是瞬間達到的速度。而與實(shí)驗相關(guān)的平均升降溫速度只有少量廠(chǎng)標明。以平均2度和4度(能做到平均升降溫4度的儀器少)來(lái)計算,從95度降到55度,分別是20秒和10秒,每個(gè)循環(huán)差20秒鐘。以般35個(gè)循環(huán)來(lái)計算,...
在PCR儀上完成個(gè)PCR反應所需要的時(shí)間決定于以下幾個(gè)因素:
1、模塊升溫和降溫時(shí)間
2、模塊與PCR管內溫度平衡時(shí)間
3、延伸時(shí)間
4、循環(huán)次數
下面就以上幾點(diǎn)做點(diǎn)分析,以便大了解快速PCR技術(shù)與快速PCR儀的區別。

1、模塊升溫和降溫度時(shí)間
PCR儀般會(huì )標明升溫速度和降溫速度,但標的大多是大變溫速度,也就是說(shuō)是瞬間達到的速度。而與實(shí)驗相關(guān)的平均升降溫速度只有少量廠(chǎng)標明。以平均2度和4度(能做到平均升降溫4度的儀器少)來(lái)計算,從95度降到55度,分別是20秒和10秒,每個(gè)循環(huán)差20秒鐘。以般35個(gè)循環(huán)來(lái)計算,影響實(shí)驗時(shí)間700秒,也就是不到12分鐘。實(shí)際還要考慮過(guò)沖問(wèn)題,影響時(shí)間還會(huì )少些。

2、模塊與PCR管內溫度平衡時(shí)間
模塊溫度達到后,PCR管內的溫度遠沒(méi)有達到(塑料和水的導熱系數比鋁塊差300倍以上),需要時(shí)間來(lái)使者達到平衡。般有四種辦法來(lái)減少這時(shí)間,是讓模塊溫度過(guò)沖,在管內溫度快達到時(shí)降到目標溫度,但太的過(guò)沖可能造成實(shí)際溫度過(guò)沖,影響PCR反應結果;是減少PCR反應液的體積,但體積變小時(shí)PCR反應的可靠性會(huì )降低;三是降低PCR管的厚度,但太薄時(shí)強度不夠;四是增加PCR管與模塊貼附程度。

3、延伸時(shí)間
延伸時(shí)間與PCR產(chǎn)物的長(cháng)度和DNA聚合酶的合成速度有關(guān)。如果PCR產(chǎn)物長(cháng)度少于100bp時(shí),可能考慮將延伸時(shí)間變?yōu)?(即兩步法);采用速的DNA聚合酶也是常用的方法,但并不是所有PCR實(shí)驗都可以用速的DNA聚合酶。

4、循環(huán)次數
循環(huán)次數與模板量及檢測要求相關(guān)。

所謂快速PCR技術(shù)是將快速PCR儀與超薄管(或特殊貼附技術(shù))以及速DNA聚合酶等技術(shù)整合在起,可達到較短時(shí)間完成PCR反應。而些廠(chǎng)在向用戶(hù)推銷(xiāo)PCR儀時(shí),不去說(shuō)明快速PCR技術(shù),只強調PCR儀速度快(大都用大升降溫速度來(lái)HuYou用戶(hù))。好像買(mǎi)了快速PCR儀后,原來(lái)1個(gè)半小時(shí)的擴增時(shí)間變會(huì )縮短成半小時(shí)似的。而用戶(hù)采購了快速PCR儀后才發(fā)現并不那么回事。有不少用戶(hù)采用快速模式根本就做不出好的實(shí)驗結果。特別是進(jìn)行多重PCR擴增的用戶(hù),如公安系統用于身份鑒定的試劑。

快速PCR技術(shù)與快速PCR儀是兩回事??焖貾CR儀多只能縮短PCR反應時(shí)間10分鐘左右,要實(shí)現真正的快速PCR反應,還需要其他些努力。大多數用戶(hù)根本就不需要快速PCR技術(shù)。

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